改革開放30年來，遼寧中醫藥大學逐步發展成為一所培養中醫、中藥、針灸推拿、中西醫臨床醫學和高級護理人才以及為中醫藥行業服務的高級專門人才的高等醫學院校。特別在學科建設方面，該校貫徹“不求最大,但求最強”的辦學理念，根據“中醫藥教育為主，多學科協調發展”的辦學思路，形成了以市場需求為導向，中醫藥學專業門類為主體，醫、理、工、管、文多學科專業相互支撐發展的基本格局。

　　30年來，該校學科建設大致經歷了3個發展階段，第一階段是1978年至2001年，在這一階段中，學校的學科建設取得了一些突破性成果，主干學科先后獲得了碩士、博士學位授予權，高層次人才培養體系逐步建立，從而結束了單純培養本科人才的歷史。第二階段是2002年至2005年，這一階段是學校學科建設逐步走上規范化發展的階段，國家和地方政府加大了對高校學科建設的管理力度，審定了重點學科，并對重點學科予以經費投入。通過主動、有計劃地開展學科建設，學校取得了主干學科的一級學科博士學位授予權，還建立了博士后科研流動工作站。第三階段從2006年起，學校的學科建設步入了一個新的歷史時期。

　　經歷了不同歷史時期洗禮，學校上下對學科建設的認識不斷提高。認為學科建設不僅僅是申報幾個研究生學位點和申報幾個本科專業的事情，而是全面地提高教學、科研水平，提高人才培養質量，增強社會服務功能以及加強重點實驗室建設、加強教學科研基地建設的一攬子建設工程，要以中醫藥學科為主體，多學科協調發展。

　　學校現有5個學科門類的12個本科專業，其中，醫學類專業多為成熟專業，培養了大批的專業人才，在國內同行業中具有較強的競爭實力和特色優勢。管理學門類和工學門類專業為新辦專業，處于發展初期，具有良好的發展潛力。

　　學校擁有中醫學、中藥學和中西醫結合3個一級學科的碩士學位授予權；擁有法學類二級學科思想政治教育學科的碩士學位授予權。碩士學位授權學科（二級學科）共計19個；擁有2個一級學科的博士學位授予權；還建立了中醫學、中西醫結合、中藥學3個博士后科研流動工作站，形成了以中醫藥學科門類為主的高層次人才培養體系，為培養相關學科門類的高層次專門人才奠定了堅實的基礎。

　　在主干學科基地建設方面，學校擁有3所附屬醫院，有30所教學醫院、實習醫院和24家藥學實習基地。有1個國家級實驗室，5個國家中醫藥管理局科研三級實驗室，17個國家中醫藥管理局科研二級實驗室，6個省級重點實驗室，1個研究院，6個研究所，還建有圖書館、人體生命科學館、中藥標本館、醫史教育博物館和校史館。

　　在重點學科建設方面，遼寧中醫藥大學擁有國家級重點學科1個：中醫基礎理論學科；省級重點學科6個：中醫基礎理論、方劑學、中醫內科、中西醫結合臨床、生藥學、中藥學；省級重點培育學科1個：針灸推拿學；國家中醫藥管理局重點學科4個：中藥生藥學科、中醫基礎理論學科、中醫兒科學科、中醫外科肛腸學科。同時，為了確保學校的學科建設可持續發展，學校還遴選了8個校級重點學科，呈現著良好的發展勢頭。