蒙醫(yī)藥是蒙古族豐富文化遺產(chǎn)的一部分，也是祖國(guó)醫(yī)學(xué)的重要組成部分。蒙醫(yī)以“三根”學(xué)說(shuō)為主要理論基礎(chǔ)（三根——赫依、希拉、巴達(dá)干），同時(shí)還包括陰陽(yáng)五行、五元學(xué)說(shuō)、七素及六基癥學(xué)說(shuō)。蒙醫(yī)治病方法，除藥物治療以外，還有傳統(tǒng)的灸療、針刺、正骨、冷熱敷、馬奶酒療法、飲食療法、正腦術(shù)、藥浴、天然溫泉療法等。

　　13世紀(jì)初，成吉思汗統(tǒng)一了遼闊的大漠南北各部落，建立了蒙古帝國(guó)，蒙古社會(huì)進(jìn)入了新的歷史發(fā)展階段。隨蒙古帝國(guó)的興起和強(qiáng)大，同國(guó)內(nèi)各兄弟民族，特別是同漢、藏族之間的往來(lái)更加密切，與印度、阿拉伯和歐洲等國(guó)家的通商及文化交流也隨之開始，蒙古族經(jīng)濟(jì)、文化得到了全面發(fā)展，蒙醫(yī)傳統(tǒng)療法及臨證用藥、理論、實(shí)踐等諸方面得到了進(jìn)一步的發(fā)展與提高。

　　17世紀(jì)以后，蒙醫(yī)學(xué)家將藏醫(yī)、印度醫(yī)學(xué)的理論與蒙古傳統(tǒng)醫(yī)藥結(jié)合起來(lái)，編撰了大量的蒙醫(yī)藥著作，為蒙醫(yī)藥的發(fā)展奠定了理論基礎(chǔ)。18世紀(jì)，蒙醫(yī)學(xué)家伊希巴拉珠爾在《甘露匯集》中首次提出了“六種基本病癥”理論（赫依、希拉、巴達(dá)干、血液、希拉烏素、粘蟲）等蒙醫(yī)獨(dú)特的“六基癥”理論，補(bǔ)充和發(fā)展了《四部醫(yī)典》的內(nèi)容。

　　元代飲膳太醫(yī)、蒙古族營(yíng)養(yǎng)學(xué)家忽思慧，用漢文編著了《飲膳正要》一書，內(nèi)容豐富，圖文并茂，記載了大量的蒙古族飲食衛(wèi)生及飲食療法、各種食物、有關(guān)驗(yàn)方和營(yíng)養(yǎng)學(xué)方面的內(nèi)容，此書成為我國(guó)最早的營(yíng)養(yǎng)學(xué)專著，生活在草原、森林地區(qū)的蒙古人對(duì)草藥的知識(shí)掌握比較多，隨著他們與國(guó)內(nèi)兄弟民族和阿拉伯、印度以及歐洲國(guó)家之間的經(jīng)濟(jì)、文化交流的不斷發(fā)展，不僅推動(dòng)了社會(huì)的進(jìn)步，同時(shí)也推動(dòng)了中外醫(yī)藥學(xué)知識(shí)方面的聯(lián)系和交流，內(nèi)地和國(guó)外的藥物也不斷傳入到蒙古地區(qū)，特別是西域人（泛指新疆和阿拉伯地區(qū)）的藥物大量進(jìn)入蒙古地區(qū)，1292年元統(tǒng)治者在今內(nèi)蒙古錫林郭勒盟正蘭旗所建的避署行宮設(shè)立了“回回藥物院”。1576年后，藏醫(yī)經(jīng)典著作隨西藏黃教傳到蒙古地區(qū)。古印度大藏經(jīng)《甘珠爾》、《丹珠爾》于17世紀(jì)被譯成蒙文，其中包括古代印度“阿輸吠陀”（Ayur.Veda）醫(yī)學(xué)巨著。這些醫(yī)著在蒙醫(yī)的發(fā)展史上發(fā)揮了重要作用。

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