嬰幼兒正處于腦發育的第二個關鍵時期。和胎兒一樣，對碘缺乏極為敏感。胎兒的嚴重碘缺乏若延續到嬰兒期繼續存在，勢必發展成為典型的克汀病患者。如果幼兒碘缺乏程度較輕，將可能出現克汀病征候譜的輕度組合，或成為亞臨床克汀病或僅有輕度智力低下。在嬰兒期僅表現為對周圍的人和事物反應及自身運動能力、智能和生長發育落后。較少出現甲狀腺腫。嬰幼兒和胎兒一樣是評估碘缺乏病流行程度的目標人群之一。